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通過研究胚胎干細(xì)胞調(diào)節(jié)DNA包裝的機制發(fā)現(xiàn)了一個心臟形成的新調(diào)控因子??茖W(xué)家們說發(fā)現(xiàn)這種發(fā)現(xiàn)遺傳調(diào)控因子的方法或許有能力提供關(guān)于身體內(nèi)所有組織如肝、腦、血液等等形成的深入了解。干細(xì)胞有潛力成為所有的細(xì)胞類型。一旦做出選擇,這種細(xì)胞和其他的干細(xì)胞堅持一樣的命運劃分形成器官組織。一個由華盛頓大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的研究小組對于干細(xì)胞如何轉(zhuǎn)變?yōu)樾募∫赃M(jìn)一步研究通過組織再生修復(fù)受損心臟特別地感興趣。這一項目的主要參與者包括心臟病理學(xué)家和干細(xì)胞生物學(xué)家Charles Murry博士,從事胚胎發(fā)育控制研究的Randall Moon博士,以及負(fù)責(zé)探究人類基因組的操作系統(tǒng)的John Stamatoyannopoulos博士。論文的*作者是華盛頓大學(xué)博士生Sharon Paige。研究結(jié)果發(fā)表在9月28日的Cell雜志上。
Paige是一個心有抱負(fù)的兒科心臟病專家,他說:“通過確定心臟發(fā)育的調(diào)控因子,這項工作有可能促成對于先天性心臟病病因得的更好了解,從未為治療進(jìn)展鋪平了道路。”以往華盛頓大學(xué)的研究人員研究了促使細(xì)胞生成各種心臟組織的信號。在本研究中,他們進(jìn)入了一個相對未經(jīng)探索的領(lǐng)域。他們決定探究干細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)樾呐K組織背后的遺傳調(diào)控。由于干細(xì)胞會將它們的DNA密碼維持在保密狀態(tài)直至需要之時,科學(xué)家們研究了這種包裝隨時間改變允許讀取部分密碼,由此引起細(xì)胞內(nèi)改變的機制。DNA被包裝在一種稱為染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)中。Murry解釋說:“DNA可以被包裝成緊密關(guān)閉、中間狀態(tài)或激活狀態(tài)。緊密關(guān)閉狀態(tài)類似于汽車上的剎車。”就像一個閉口不言的孩子當(dāng)他問道:“你長大時會是什么樣?”干細(xì)胞保護著那些將決定它們未來細(xì)胞類型的基因,或科學(xué)家們稱之為的它們的細(xì)胞命運。
Murry說:“我們發(fā)現(xiàn)干細(xì)胞非常謹(jǐn)慎地避免在錯誤的時間開啟細(xì)胞命運的調(diào)控基因。這些基因帶著剎車直到需要它們之時。正確的時間剎車被除去。”他解釋說相比那些調(diào)控細(xì)胞命運的基因,調(diào)控細(xì)胞功能的基因情況有所不同。例如調(diào)控使細(xì)胞收縮或生成電信號的蛋白質(zhì)生成的基因就沒有這樣復(fù)雜的剎車系統(tǒng)。這些基因可以被更輕易地激活。研究人員指出人們已經(jīng)知道干細(xì)胞遵循修飾DNA包裝將它們與祖細(xì)胞及其具有功能特性的細(xì)胞例如血液細(xì)胞或肌肉細(xì)胞區(qū)分開來的模式。然而對于DNA包裝修飾的動態(tài)——包裝如何隨時間變成發(fā)生改變——以及這些動態(tài)影響了哪些“暴露”的基因并激活生成了心肌細(xì)胞還知之甚少。這一研究小組了解到隨著人類胚胎干細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)樾呐K細(xì)胞, DNA包裝中特征性的動態(tài)改變伴隨著分化。這種信號燈模式使得科學(xué)家們將心臟發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)控因子與其他基因區(qū)分開來。研究人員將DNA包裝中這種嚴(yán)格的定時模式稱之為“時間染色質(zhì)標(biāo)記”。就像一個銀行搶劫犯在給銀行出納員的一張手寫字條中留下了罪證,這種時間染色質(zhì)標(biāo)記為科學(xué)家們提供了他們尋找有可能負(fù)責(zé)心臟形成的新基因所需的線索。
“我們發(fā)現(xiàn)了一群,”Murry說。他們的系統(tǒng)揭示的*候選基因就是同源盒基因(homeobox gene)MEIS2。這一基因似乎是一種不可能的選擇因為它從前未有任何參與心臟形成的記錄。然而,當(dāng)研究人員從新一代的斑馬魚中移除這一基因時,發(fā)育中的斑馬魚胚胎具有心臟管形成缺陷和其他的心臟異常。Murry和研究小組的其他成員認(rèn)為DNA解包裝模式可以廣泛地適用于發(fā)現(xiàn)調(diào)控不僅心臟還有其他組織和器官形成方面的基因。這樣的一種研究方法可能有助揭示隨胚胎形成以及生長而發(fā)生在細(xì)胞中的主要發(fā)育決定。這些發(fā)現(xiàn)可能提供有用的信息促進(jìn)干細(xì)胞形成特異組織用于生命后期器官修復(fù)。認(rèn)識到實驗室系統(tǒng)在模擬人類器官形成早期階段活細(xì)胞中發(fā)生事件方面的局限性,Murry說:“利用這一時間染色質(zhì)標(biāo)記來發(fā)現(xiàn)調(diào)控基因能夠帶給我們關(guān)于人類發(fā)育的新認(rèn)識以及調(diào)控細(xì)胞命運的新工具。”